Acylation酰化蛋白组
赖氨酸(K)作为构成蛋白质唯一一个侧链含有ε-氨基的氨基酸。由于带正电荷的 ε 氨基侧链,赖氨酸残基会受到各种不同翻译后修饰的调控。从代谢中间产物乙酰辅酶 A、琥珀酰辅酶 A、丙二酰辅酶 A、丁酰辅酶 A、丙酰辅酶 A 及巴豆酰基辅酶 A 中转移的酰基全都会中和赖氨酸的正电荷,然后造成影响底物蛋白功能的结构改变。受酰化调控的细胞功能,包括细胞周期调控、线粒体代谢、细胞骨架调节、蛋白质间的相互作用及其他功能。故而赖氨酸(K)是生物体内存在翻译后修饰种类最多的一种氨基酸。除了甲基化,目前已经发现的修饰模式主要还包括酰基化。
赖氨酸的酰基化种类繁多,且对细胞的结构与功能都有重要的调控作用。一些翻译后修饰早在化学生物学发展之初即被发现,如乙酰化(Acety-lysine,Ac-K)等修饰。随着串级质谱与蛋白质组学的发展,许多新型赖氨酸酰基化修饰模式被逐渐发现,包括戊二酰化(Glutaryl-Lysine,Glut-K)、丙二酰化 (Malonyl-Lysine,Mal-K)、丙酰化 (Propionyl-Lysine,Prop-K) 和琥珀酰化 (丁二酰化,Succinyl-Lysine,Succ-K) 等。
乙酰化 其他酰化 修饰富集 技术流程 产品信息 案例解读
蛋白质乙酰化是一种重要的蛋白质翻译后修饰,是一个在细胞核或细胞质的亚细胞器内广泛存在的翻译后修饰调控机制,参与了转录、趋化作用、新陈代谢、细胞信号转导、应激反应、蛋白质水解、细胞凋亡,以及神经元的发育等多个过程。通常在乙酰基转移酶(KAT)的催化下,蛋白在转录过程或后转录过程中发生乙酰化修饰,此乙酰基集团可以被连接在氨基酸的N端,也就是N-乙酰化;或者连接在氨基侧链的赖氨酸残基上。
蛋白质的乙酰化修饰主要有两种,N-乙酰化和赖氨酸(Lysine)乙酰化修饰。
N-乙酰化
N-乙酰化有两类乙酰化形式:Nα乙酰化和Nε乙酰化。N-乙酰化是指蛋白质的N末端被乙酰化修饰,一般认为不可逆,在真核生物中非常普遍,在原核生物中却非常少见。大部分实验表明N-乙酰化通常发生在丝氨酸,丙氨酸和苏氨酸的N端残基上,并且此修饰发生过程中有几种不同的N-乙酰基转移酶参与,随后执行不同分子功能。
赖氨酸(Lysine)乙酰化
赖氨酸残基发生乙酰化是一个可逆的过程,通过乙酰化修饰影响蛋白之间相互作用和蛋白与DNA的相互作用。在组蛋白乙酰化和去乙酰化过程中,对赖氨酸N末端进行修饰从而影响基因调控。除组氨酸修饰之外,还有很多非组蛋白的赖氨酸残基发生乙酰化。赖氨酸(Lys)乙酰化修饰异常可能引起各种疾病,包括癌症,糖尿病,心血管疾病以及神经退行性疾病等。
除乙酰化修饰外,在蛋白质赖氨酸(K)残基上还存在其他的酰基化修饰,包括戊二酰化(Glutaryl-Lysine,Glut-K)、丙二酰化 (Malonyl-Lysine,Mal-K)、丙酰化 (Propionyl-Lysine,Prop-K) 和琥珀酰化 (丁二酰化,Succinyl-Lysine,Succ-K)等。检测分析流程与研究思路与乙酰化修饰类似。
戊二酰化(Glutaryl-Lysine,Glut-K)
丙二酰化 (Malonyl-Lysine,Mal-K)
丙酰化 (Propionyl-Lysine,Prop-K)
琥珀酰化 (丁二酰化,Succinyl-Lysine,Succ-K)
蛋白质组学水平上研究出一种检测赖氨酸乙酰化的方法,即用赖氨酸乙酰化特异性抗体富集乙酰化肽段,再利用液相色谱质谱联用(HPLC/MS)的方法进行检测。
1.产品描述:大规模酰化修饰蛋白质组学(乙酰化、戊二酰化、丙二酰化、丙酰化、琥珀酰化)-对客户提供的不同组别的样本进行酰化修饰(乙酰化、戊二酰化、丙二酰化、丙酰化、琥珀酰化)蛋白质组学分析,鉴定获得所有样本的酰化修饰位点/肽段/蛋白信息,定量筛选不同组别样本之间显著性差异表达的酰化修饰位点,并对相关酰化修饰蛋白进行生物信息学分析。
2.样品要求:
2.1. 常规人、动物组织(比如肝脏、肾脏、脑组织等):≥2g;
2.2. 软体动物:≥2g;
2.3. 动物坚韧组织(软骨、毛发等):≥5g;
2.4. 植物叶片等鲜嫩组织:湿重≥5g;
2.5. 植物富含杂质或蛋白含量低的样本,如植物根,根茎、木质部、韧皮部组织等:干重≥10g;
2.6. 植物花粉:≥400mg;
2.7. 藻类组织:≥5g;
2.8. 细胞样本数目须达到:2*107(建议使用本公司的裂解液进行裂解之后再进行寄送);
2.9. 微生物菌类:≥300µL纯菌体;
2.10. 体液类(唾液、羊水、脑脊液等)10 mL以上,不能溶血;血清500 μl以上;尿液50 mL以上。
2.11. 其他特殊样本如有疑问请联系我们。
3.质谱信息:Orbitrap Fusion(Thermo Scientific),Orbitrap Elite(Thermo Scientific)
4.测试周期:30个工作日
5.报告信息:测试报告、修饰位点/肽段/蛋白质鉴定列表(电子版)、显著性分析列表(电子版)、生物信息学报告、原始质谱测试文件
6:生信分析:
6.1. 质谱数据质量分析
6.2. 显著性差异统计分析
6.3. GeneOntology注释和富集分析
6.4. KEGG注释和富集分析
6.5. 蛋白质互做网络PPI分析
6.6. 蛋白修饰PTM分析
1. MCP2017-三角褐指藻脂肪酸代谢途径的乙酰化蛋白质组学分析 Acetylome Profiling Reveals Extensive Lysine Acetylation of the Fatty Acid Metabolism Pathway in the Diatom Phaeodactylum tricornutum 2.JPR2018-锥体虫赖氨酸乙酰化修饰蛋白质组学分析 Comparative Proteomic Analysis of Lysine Acetylation in Trypanosomes 3.MCP2019-水稻灌浆期种子赖氨酸琥珀酰化修饰和其他修饰联合分析 Comprehensive analysis of the lysine succinylome and protein comodifications in developing rice seeds