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2022-基于蛋白质组学和代谢组学数据综合分析镍离子与L929细胞的相互作用机制-东南大学-Regenerative Biomaterials-工程技术2区-IF:5.76
The interaction mechanism of nickel ions with L929 cells based on integrative analysis of proteomics and metabolomics data.
Regenerative Biomaterials, 2022.
Zhang Y, Huang Y, Chen R, et al.
本研究主要目的是结合蛋白质组学和代谢组学研究镍离子(Ni2+)对L929细胞的毒性机制分析。首先,基于 iTRAQ 的蛋白质组学和 LC/MS 代谢组学分析用于确定 L929 细胞在用 100 μM Ni2+ 处理 12、24 和 48 h 后的蛋白质和代谢物表达谱。共有 177、2191 和 2109 种蛋白质和 40、60 和 74 种代谢物被发现存在差异表达。然后,确定了同时涉及差异表达的蛋白质和代谢物的代谢途径,并且蛋白质和代谢物表现出上游和下游关系的三个途径在所有三个时间点都受到影响。此外,构建了蛋白质-代谢物-代谢途径网络,确定了两条重要的代谢途径,涉及4种代谢物和17种蛋白质。最后,对筛选出的重要代谢途径、代谢物和蛋白质的功能进行了研究和实验验证。 Ni2+主要影响谷胱甘肽代谢途径和精氨酸、脯氨酸代谢途径上游蛋白的表达,进一步调节下游代谢物的合成,降低细胞的抗氧化能力,增加超氧阴离子水平和GSSG与GSH的比值,导致氧化应激,影响能量代谢并诱导细胞凋亡。
本文涉及维基生物技术服务产品:iTRAQ标记定量蛋白质组学