LabelFree非标定量

非标记定量(Label free) 蛋白质组学技术
Label-free quantitative proteomics(Label free)technology

蛋白质非标记定量技术(Label-free)是通过多维液质联用技术(Multidimensional Protein Identification,MudPIT)对蛋白质酶解肽段进行质谱分析,不需使用费用较贵的稳定同位素标签(iTRAQ,TMT等)做内部标准,只需分析大规模鉴定蛋白质时所产生的质谱数据,比较不同样品中相应肽段的信号强度,从而对肽段对应的蛋白质进行相对定量。

 

技术原理 技术流程 产品信息 成功案例

按照定量策略,非标记定量方法可以分为两种:
1.Spectrum counts的定量方法:发展比较早,已经形成多种定量算法,但主要原理都是以MS2的鉴定结果为定量基础,各种方法的差别在于后期算法在大规模数据上的修正。
2.另一种非标记定量方法的原理是以MS1为基础,计算每个肽段的信号强度在LC-MS色谱上的积分。MaxQuant是目前为止的蛋白质组学非标定量标准算法,现在已成为蛋白质组学领域内的非标定量计算的主流方案。

 

1.产品描述:非标记定量比较蛋白质组学-对客户提供的不同组别的样本进行蛋白质组学分析,鉴定获得所有样本的肽段/蛋白信息,定量筛选不同组别样本之间显著性差异表达的蛋白质,并对显著性差异蛋白质进行生物信息学分析。

2.样品要求
2.1. 常规人、动物组织(比如肝脏、肾脏、脑组织等):≥100mg;
2.2. 软体动物:≥100mg;
2.3. 动物坚韧组织(软骨、毛发等):≥500mg;
2.4. 植物叶片等鲜嫩组织:湿重≥1g;
2.5. 植物富含杂质或蛋白含量低的样本,如植物根,根茎、木质部、韧皮部组织等:干重≥2g;
2.6. 植物花粉:≥100mg;
2.7. 藻类组织:≥1g;
2.8. 细胞样本数目须达到:105(建议使用本公司的裂解液进行裂解之后再进行寄送);
2.9. 微生物菌类:≥50µL纯菌体;
2.10. 体液类(唾液、羊水、脑脊液等)1 mL以上,不能溶血;血清50 μl以上;尿液10 mL以上。
2.11. 其他特殊样本如有疑问请联系我们。

3.质谱信息Orbitrap Fusion(Thermo Scientific),Orbitrap Elite(Thermo Scientific)

4.测试周期:15个工作日

5.报告信息:测试报告、肽段/蛋白质鉴定列表(电子版)、显著性分析列表(电子版)、生物信息学报告、原始质谱测试文件

6:生信分析
6.1. 质谱数据质量分析
6.2. 显著性差异统计分析
6.3. GeneOntology注释和富集分析
6.4. KEGG注释和富集分析
6.5. 蛋白质互做网络PPI分析

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