项目文章
2016-Plos One-IF 2.81-Fujian Agriculture and Forestry University-Black Rice-iTRAQ Proteomics
iTRAQ-Based Quantitative Proteomics Analysis of Black Rice Grain Development Reveals Metabolic Pathways Associated with Anthocyanin Biosynthesis.
PLoS One. 2016 Jul 14;11(7):e0159238. doi: 10.1371/journal.pone.0159238. eCollection 2016.
背景：黑米（Oryza sativa L.）的果皮富含花青素（ACN），被认为是白米的更健康替代品。黑米中ACN的分子种类在先前的研究中已有充分的文献记载。然而，有关黑米粒发育过程中ACN生物合成基础代谢机制的信息尚不清楚。
结果：本研究的目的是确定黑rice稻（Oryza sativa L. indica var。SSP）发育过程中动态谷物蛋白质组所涉及的代谢途径的变化。用于相对定量和绝对定量（iTRAQ）MS / MS的等压标签用于鉴定谷物蛋白质组中的统计学显着变化。从开花后3到20天（DAF）开始，检测到大约928种蛋白质，其中230种在5个连续的发育阶段差异表达。在7个和10个DAF上观察到最多数量的差异表达蛋白质，包括76个上调的蛋白和39个下调的蛋白。基因本体的生物学过程分析表明，230个差异表达的蛋白质可以分为14个功能组。最大的一组蛋白质与代谢过程有关，可以整合到多种生化途径中。特别是，在ACN生物合成，糖合成和基因表达调节中起作用的蛋白质，特别是在黑米粒发育开始和发育过程中，被上调。相反，在谷物成熟过程中，与信号转导，氧化还原稳态，光合作用和N代谢相关的蛋白质表达下降。最后，通过定量实时聚合酶链反应（qRT-PCR）分析验证了编码不同代谢蛋白的8个代表性基因，这些基因在谷物发育过程中的转录和翻译表达有所不同。
结论：属于不同功能类别和亚类别的代谢相关蛋白质组的表达分析表明，明显上调的蛋白质与类黄酮和淀粉合成有关。另一方面，确定下调的蛋白质与氮代谢以及其他功能类别和子类别有关，包括光合作用，氧化还原稳态，生育酚生物合成和信号转导。结果为黑米中ACN颜料的生产表征和理解提供了有价值的新见解。
论文涉及维基服务产品： iTRAQ标记定量