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多组学实验及数据分析系列研习会（第三期）
多组学实验及数据分析系列研习会（第三期）之转录组学、蛋白质组学和代谢组学
在后基因组时代，生命科学研究开始进入系统、全面、动态的功能探索阶段。多种高通量的研究策略如基因组测序、转录组测序、小RNA测 序、蛋白质组定量实验和代谢组学被组合应用到同一个课题研究中，在原先单个平台产出数据分析挖掘的的基础上增加了多个实验平台产出数据的整合分析。本系列 研习会将深入探讨不同平台的实验方法、研究策略、实验设计和数据分析，并介绍多组学实验整合研究的案例，研讨内容由多年实践经验的科研和技术人员进行讲解 和带领数据分析的实际上机操作。
主办单位：上海生咨生物科技有限公司
支持单位：上海维基生物科技有限公司
时间：2015年8月11日－8月15日
地点：上海良友饭店，静安区南苏州路1455号
| 8月11日（周二）下午14：30－17：30 或8月12日上午8:30-9:30注册。 | |
| 上午（9：30-12：00） | 1. 蛋白质组学常用实验方法
1.1 基于凝胶技术的定量蛋白质组学 1.2 基于质谱技术的蛋白质组学研究 |
| 8月12日（周三）
下午（13:30-17:30） |
2.蛋白质搜库和差异蛋白筛选
2.1 蛋白质组学数据分析搜索引擎 2.2 如何提高蛋白鉴定覆盖度 2.3 质谱搜库软件演示和maxquant上机实习 2.4 差异蛋白筛选方法 |
| 8月13日（周四）
上午（9:00-12:00） |
3.转录组实验设计和数据分析
3.1 转录组测序数据分析及其在临床医学方面的应用研究 |
| 8月13日（周四）
下午（13:30-17:30） |
4.蛋白质组数据分析
4.1 NCBI、UNIRPOT数据库资源介绍 4.2 Gene Ontology介绍 4.3 KEGG网站介绍 4.4 蛋白质组学数据分析 |
| 8月14日（周五）
上午（9:00-12:00） |
5.蛋白相互作用网络分析功能介绍和上机操作
5.1 cytoscape 5.2 pajek 5.3 STRING |
| 8月14日（周五）
下午（13:30-17:30） |
6.常用分析上机练习包括：
6.1 维恩分析 6.2 层次聚类和热图 6.3 k-means聚类 6.4 主成分分析 6.5 GO功能分析和富集分析 6.6 KEGG通路分析 6.7 DESeq |
| 8月15日（周六）
上午（9：00－12：00） |
7. 代谢组学研究方法
7.1 代谢组学实验设计及样本处理 7.2 代谢组学数据处理－多维统计分析 |
| 8月15日（周六）
下午（13：30－17：30） |
8. 多组学整合分析案例介绍
9. 科研工作中的专利挖掘和专利保护 自由上机和交流 |
讲师信息
侯辰瑞
资深蛋白质组学工程师，具有超过10年的蛋白质组学方向的从业经历，承接过大量的不同类型、不同物种的蛋白质组学服务项目，在实验设计和实施上有丰富的经验。
吴谦
博士 副研究员，上海生物信息技术研究中心质谱平台负责人，从事质谱研究十多年，近年研究方向主要为蛋白质组学、代谢组学及质谱定量分析新方法开发。
于复东
博士、副研究员。2008年1月毕业于中国科学院上海生命科学研究院，获生 物信息学博士学位。毕业后一直从事二代测序等高通量数据分析、肿瘤基因组学、及相关数据库开发和分析平台建立等生物信息学研究工作。目前主要从事肿瘤基因 组学方面的研究工作，运用系统生物学的方法研究可以应用于临床早期诊断、预后、复发和转移相关的分子标志物基因及其功能等。近年来作为项目负责人完成了国 家自然科学基金、上海市博士后基金、上海市白玉兰科技人才基金各一项，作为生物信息学分析平台负责人完成传染病重大专项课题一项，作为技术骨干参与完成863计划项目一项，累积发表SCI论文十余篇。
俞鸿
上海生咨生物科技有限公司经理，资深生物信息学工程师 具有超过10年生物信息学分析经验。参与了水稻基因组、家蚕基因组、人肝蛋白质组计划以及其他的国家973、863计划及国家自然科学基金等项目。主要从事蛋白质组、基因组方向的数据分析.