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2022-不同分区玉米根系对水分吸收利用的蛋白质组学分析-河南安阳农业科学院-BMC genomics-生物2区-IF3.68
Label-free quantitative proteomics of maize roots from different root zones provides insight into proteins associated with enhance water uptake.
Song J, Lu D, Niu Y, et al.
BMC genomics, 2022, 23(1): 1-22.
玉米是世界上最重要的粮食作物之一。根系在玉米生产力中起重要作用通过从土壤中吸收水分和养分。改善玉米根部性状以有效吸水将有助于优化灌溉并促进可持续玉米生产。因此，本文研究了蛋白质谱玉米品种Anyu308根系按标签分为上根区（UR）、中根区（MR）和下根区（LR）的非标记定量蛋白质表达谱分析。生理结果表明在田间容量MR的吸水量高于 UR 和 LR。蛋白质组共鉴定出 489 个差异表达蛋白（DAP）。DAP的聚类分析显示 MR 和 UR具有与 LR 不同的相似蛋白质丰度模式。与 MR/UR 相比，更多的蛋白质差异丰富到 LR/MR 和 LR/UR。蛋白质谱的比较表明，MR 中的 DAP 丰度增加，与对 UR 和 LR 具有更多下调的 DAP。丰度模式、功能类别和途径富集分析强调染色质结构和动力学、核糖体结构、多糖代谢、能量代谢和运输、水通道的诱导、无机离子运输、细胞内运输和囊泡运输和翻译后修饰作为与增强的根水相关的主要生物过程玉米中的摄取。具体来说，组蛋白、核糖体蛋白和水通道蛋白（包括线粒体）的丰度电子传递蛋白和 TCA 循环是 MR 增强水吸收的基础。此外，蛋白质参与折叠和血管运输支持溶质在 UR 和 MR 中跨细胞膜的径向运输。平行反应监测分析PRM用于确认通过基于 LFQ 的蛋白质组学获得的 DAP 的概况。最后结果表明在 MR 中鉴定的差异丰富蛋白质列表是进一步阐明的有趣候选者它们在增强水吸收中的作用。
本研究涉及维基生物技术服务产品：非标记标记定量蛋白质组学 PRM蛋白质谱