项目文章
2021-小白菜菌鳃中 pedunsaponin A 靶蛋白的鉴定及功能验证-四川农业大学-Pest management science(IF:4.84)
Identification and functional verification of the target protein of pedunsaponin A in the gills of Pomacea canaliculata.
Yang C, Ma Y, Wang B, et al.
Pest Management Science, 2021.
之前研究表明芍药苷A（PA）可以破坏小白菜的鳃，本实验以鳃为主要研究对象，通过蛋白质组学和RNA干扰（RNAi）技术鉴定了小白菜鳃中PA的靶蛋白。蛋白质组学表明，在 P. canaliculata 中，PA 处理后 180 种蛋白质被下调。其中，通过生物信息学分析选择了advillin（PcAdv）、受体型酪氨酸蛋白磷酸酶（PcRT）和非常规肌球蛋白重链6（PcUM）作为候选靶蛋白。通过进一步筛选，确定了干扰效果最好的小干扰RNA（siRNA）。 PcAdv、PcRT 和 PcUM 的基因干扰率分别为 97%、98% 和 82%。结果表明，经RNAi处理后，PcAdv处理的P. canaliculata死亡率（60.0%）显着低于对照（93.3%）；组织学分析表明，鳃结构完整，纤毛脱落减少，血细胞存活率增加。以上结果表明，当该蛋白缺失或被抑制时，PA进入P. canaliculata血细胞的通道被阻断，从而减少了PA与血细胞的结合，鳃纤毛脱落与PA有密切关系。进入血细胞。因此，PcAdv 是 PA 破坏鳃纤毛的关键蛋白质。在鳃中定位与药物相互作用的蛋白质并研究它们的作用模式对于开发新的杀软体动物剂来控制 P. canaliculata 种群非常重要。
本实验设计维基生物技术服务产品：TMT标记定量蛋白质组学