项目文章
2020-海带甘露醇代谢相关基因转录组学和蛋白质学联合分析-中国海洋大学-Genomics, Proteomics & Bioinformatics(IF:7.05)
Transcriptomic and Proteomic Analysis of Mannitol-metabolism-associated Genes in Saccharina japonica
Chi S, Wang G, Liu T, et al.
Genomics, Proteomics & Bioinformatics, 2020 Nov 25;S1672-0229(20)30130-3.
甘露醇是褐藻中的一种储碳化合物和渗透保护剂，在海带(Saccharina japonica)中有大量合成和积累，但对其在海带里的合成机制目前不是很清晰。本研究首先通过对海带(Saccharina japonica)的基因组和转录组数据的分析表明，甘露醇代谢是由四个不同步骤组成的循环途径。甘露醇-1-磷酸脱氢酶（M1PDH2）和两个甘露醇-1-磷酸酶（M1Pase）共同或组合发挥作用，以显示出完整的酶促特性。随后基于来自不同组织，世代和性别以及在不同胁迫条件下的转录组学和蛋白质组学等确认，发现SjaM1Pase1在甘露醇的生物合成中起主要关键作用，并且是由基本的甘露醇合成代谢碳水化合物池的动力学负责碳的储存和抗压力机制。蛋白质组学数据表明，在海带的昼夜周期中，甘露醇的代谢保持恒定。此外，我们发现甘露醇代谢相关（MMA）基因在多细胞丝状（配子体）等）世代之间显示差异表达，并对环境压力（例如次生理盐水和高温条件）做出不同反应。我们的结果表明，此类与生理生态相关的差异表达基因可能更多归因于异型世代的进化以及海带对环境适应性。
论文涉及维基服务产品： TMT标记定量蛋白质组学