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多组学实验及数据分析系列研习会（第四期）
在 后基因组时代，生命科学研究开始进入系统、全面、动态的功能探索阶段。多种高通量的研究策略如基因组测序、转录组测序、小RNA测序、蛋白质组定量实验和 代谢组学被组合应用到同一个课题研究中，在原先单个平台产出数据分析挖掘的的基础上增加了多个实验平台产出数据的整合分析。本系列研习会将深入探讨转录组 和蛋白质组的实验方法、研究策略、实验设计和数据分析，并介绍转录组和蛋白质组实验整合研究的案例，研讨内容由多年实践经验的科研和技术人员进行讲解和带 领数据分析的实际上机操作。
主办单位：上海生咨生物科技有限公司
支持单位：上海维基生物科技有限公司, 上海众信生物技术有限公司，科学网，生物通
时间：2015年11月17日－11月21日
地点：上海良友饭店（Ｍotel168），静安区南苏州路1455号
报到时间：2015年11月17日14:30-17:30, 11月18日8:30-9:30
| 11月17日（周二）下午14：30－17：30 或11月18日上午8:30-9:30注册。 | |
| 11月18日（周三）
上午（9：30-12：00） |
1. 蛋白质组学常用实验方法
1.1 基于凝胶技术的定量蛋白质组学 1.2 基于质谱技术的蛋白质组学研究 |
| 11月18日（周三）
下午（13:30-17:30） |
2.蛋白质搜库和差异蛋白筛选
2.1 蛋白质组学数据分析搜索引擎 2.2 如何提高蛋白鉴定覆盖度 2.3 质谱搜库软件演示和maxquant上机实习 2.4 差异蛋白筛选方法 |
| 11月19日（周四）
上午（9:00-12:00） |
3.转录组实验设计和数据分析
3.1 转录组测序数据分析及其在临床医学方面的应用研究 |
| 11月19日（周四）
下午（13:30-17:30） |
4.蛋白质组数据分析
4.1 NCBI、UNIRPOT数据库资源介绍 4.2 Gene Ontology介绍 4.3 KEGG网站介绍 4.4 蛋白质组学数据分析 |
| 11月20日（周五）
上午（9:00-12:00） |
5.1 转录组测序在农林方面的应用研究
5.2 转录组和蛋白质组整合分析案例介绍 |
| 11月20日（周五）
下午（13:30-17:30） |
6.常用分析上机练习包括：
6.1 维恩分析 6.2 层次聚类和热图 6.3 k-means聚类 6.4 主成分分析 6.5 GO功能分析和富集分析 6.6 KEGG通路分析 |
| 11月21日（周六）
上午（9：00－12：00） |
7.1 当代蛋白质组学研究方法综述
7.2蛋白质组学在肿瘤研究中的应用 7.3蛋白质组学在药物研究中的应用 |
| 11月21日（周六）
下午（13：30－17：30） |
8.1蛋白相互作用网络分析功能介绍和上机操作(cytoscape)
8.2自由上机和交流 |
讲师信息
侯辰瑞
资深蛋白质组学工程师，具有超过10年的蛋白质组学方向的从业经历，承接过大量的不同类型、不同物种的蛋白质组学服务项目，在实验设计和实施上有丰富的经验。
何有裕 上海众信生物技术有限公司经理
库鑫 博士
2007年毕业于华中科技大学同济医学院，获学士学位。同年9月被保送至中科院上海药物研究所并于2010年取得硕士学位。2010年10月至2014年6月在德国慕尼黑工业大学（Technische Universität München）生物分析与蛋白质组学研究所（Prof. Bernhard Kuster）攻读博士学位，专业方向为基于串联质谱的蛋白质组学在肿瘤药物研究中的应用。现任职于上海交通大学系统生物医学研究院，研究方向为肿瘤相关生物标志物的发现和蛋白质糖基化修饰的研究。库鑫博士长期从事肿瘤蛋白质组学的相关研究，在国际期刊上发表过多篇相关论文。
于复东
博士、副研究员。2008年1月毕业于中国科学院上海生命科学研究院，获生 物信息学博士学位。毕业后一直从事二代测序等高通量数据分析、肿瘤基因组学、及相关数据库开发和分析平台建立等生物信息学研究工作。目前主要从事肿瘤基因 组学方面的研究工作，运用系统生物学的方法研究可以应用于临床早期诊断、预后、复发和转移相关的分子标志物基因及其功能等。近年来作为项目负责人完成了国 家自然科学基金、上海市博士后基金、上海市白玉兰科技人才基金各一项，作为生物信息学分析平台负责人完成传染病重大专项课题一项，作为技术骨干参与完成863计划项目一项，累积发表SCI论文十余篇。
俞鸿
上海生咨生物科技有限公司经理，资深生物信息学工程师 具有超过10年生物信息学分析经验。参与了水稻基因组、家蚕基因组、人肝蛋白质组计划以及其他的国家973、863计划及国家自然科学基金等项目。主要从事蛋白质组、基因组方向的数据分析.