差异蛋白数据分析

韦恩图分析 火山图 聚类分析

维恩图也叫文氏图,用于显示元素集合重叠区域的图示。

 

火山图(Volcano Plot)在组学分析中常用的一种图,它能非常直观的显示表达差异的基因或蛋白。在火山图中显示了两个重要的指标(Fold change/p-Value),检验分析出两组样本间显著差异表达的基因后,以log2(fold change)为横坐标,以显著性检验(常用的为T test) P值的负对数-log10(P-value)为纵坐标,利用一定的筛选条件(如大于1.5倍变化且P<0.05),可以筛选出显著差异表达的基因,进行后续研究。我们采用R的ggplot2包可以定制化的生成火山图。

检验所选取的差异表达蛋白质或特征差异表达蛋白质的合理性和准确性,利用筛选出的蛋白质,对各组样本进行层次聚类。

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